Identificación molecular de comunidades bacterianas del suelo presentes en una muestra del corredor monos (Filandia-Quindío) [recurso electrónico]

Abstract

El corredor biológico Barbas-Bremen, es una Herramienta de Manejo del Paisaje (HMP) implementada en Filandia, Quindío en el año 2004, por el Instituto Alexander von Humboldt, para recuperar la conectividad entre dos fragmentos de bosque. Este corredor está compuesto por cuatro conexiones entre el cañón del río Barbas y la Reserva Forestal de Bremen. Para evaluar la eficacia biológica de ésta estrategia de restauración se han utilizado bioindicadores a escala macro (flora y fauna), pero hasta el momento no se han utilizado microorganismos de suelo. Dado que los microorganismos son uno de los principales constituyentes del suelo participando activamente en la formación de su estructura y en la descomposición de la materia orgánica; es necesario incluirlos como potenciales bioindicadores en la evaluación de los procesos de restauración de suelos. Como un alto porcentaje de microorganismos requiere condiciones específicas para su crecimiento en el laboratorio y muchos de ellos no son cultivables, es necesario hacer uso de herramientas moleculares como la metagenómica, Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) y Electroforesis en Gel con Gradiente de Desnaturalización (DGGE). Para ello se tomaron muestras de suelo de dos zonas conectoras (corredores Monos y Pavas), una muestra de cada Bosque maduro (Barbas y Bremen) y una muestra del potrero junto al corredor Monos.

The biological corridor Barbas -Bremen is a Landscape Management Tool (LMT) implemented in Filandia, Quindío in 2004 by Alexander von Humboldt Institute, to restore connectivity between two forest fragments. This corridor consists of four connections between the canyon of river Barbas and the Forest Reserve of Bremen. To evaluate the biological effectiveness of this restoration strategy macroscale bioindicators have been used (flora and fauna), but so far soil microorganisms have not been used. Given that microorganisms are one of the major soil constituents, are actively involved in soil‟s structure formation, also participate in decomposition of organic matter, presenting variety of functions necessary for the existence of other organisms, it is necessary to include them as potential bioindicators in evaluation of soil restoration processes due to microorganisms are one of the main soil constituents actively involved in shaping its structure and decomposition of organic matter, it is necessary to include them as potential bioindicators in the evaluation of the processes of soil restoration. As a high percentage of microorganisms require specific laboratory growth conditions, and many of them are non-culturables. It is necessary to use molecular tools such as metagenomics, Polymerase Chain Reaction (PCR) and Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE). For it, soil samples were collected from two connecting areas (corridors Monos and Pavas), a sample of each mature forest (Barbas and Bremen) and a sample of pasturelands next to the corridor Monos.