Logo_Icesi
 

Producción, estabilización y evaluación de la enzima retrotranscriptasa recombinante obtenida a partir de Escherichia coli BL21(DE3)

dc.audienceTodo Público
dc.contributor.advisorDavid Jiménez, Steven Alexander
dc.contributor.advisorBarrera Ocampo, Álvaro Andrés
dc.contributor.authorCoy Gómez, Gabriela
dc.contributor.authorPérez Giraldo, Estefanía
dc.coverage.spatialCali de Lat: 03 24 00 N degrees minutes Lat: 3.4000 decimal degrees Long: 076 30 00 W degrees minutes Long: -76.5000 decimal degrees.
dc.date.accessioned2025-06-16T13:59:12Z
dc.date.available2025-06-16T13:59:12Z
dc.date.issued2024-06-12
dc.description.abstractMolecular tests represent a key tool in the diagnosis of various diseases, particularly those of infectious origin. During the pandemic, these tests became the cornerstone of diagnosis due to their versatility, speed, specificity, and sensitivity, as they allowed for the implementation of timely treatments and epidemiological containment measures. The RT - qPCR technique enabled the detection of the SARS - CoV - 2 virus; however, the overwhelming demand for these tests generated a shortage of critical supplies, particularly the MMVL - RT enzyme, essential for performing the technique. Therefore, in response to this scarcity and with the aim of ensuring a local supply of reverse transcriptase, Icesi University has proposed a comprehensive methodology for its obtention and storage. This methodology covers the production, stabilization, and evaluation of recombinant RT enzyme obtained in - house from Escherichia coli BL21(DE3). The work sequence includes the expression of the MMLV - RT enzyme in E. coli BL21(DE3) bacteria, followed by its purification through affinity chromatography using a histidine tag. Furthermore, the formulation of the enzyme in a storage buffer and the qualitative evaluation of enzymatic activity allowed for a comprehensive assessment of the quality attributes of the enzyme stored for one month. The result obtained was an enzyme with a high degree of purity, specific and functional, retaining its activity even after one month of storage at temperatures of 4ºC and - 20ºC.eng
dc.description.abstractLas pruebas moleculares representan una herramienta clave en el diagnóstico de diversas enfermedades, particularmente las que son de origen infeccioso. Durante la pandemia, estas pruebasse convirtieron en el pilar del diagnóstico debido a su versatilidad, rapidez, especificidad y sensibilidad pues permitieron implementar tratamientos y cercos epidemiológicos oportunos. La técnica de RT-qPCR permitió la detección del virus SARS- CoV-2; sin embargo, la abrumadora demanda de estas pruebas generó un desabastecimiento de suministros críticos, en particular, la enzima MMVL-RT, esencial para ejecutar la técnica. Por ende, en respuesta a esta escasez y con el objetivo de asegurar un suministro local de la retrotranscriptasa, la Universidad Icesi ha propuesto una metodología integral para su obtención y almacenamiento. Esta metodología abarca la producción, estabilización y evaluación de la enzima RT recombinante obtenida in-house a partir de Escherichia coli BL21(DE3). La secuencia de trabajo comprende la expresión de la enzima MMLV-RT en bacterias E. coli BL21(DE3), seguido de su purificación mediante cromatografía de afinidad utilizando una cola de histidina. Además, la formulación de la enzima en un buffer de almacenamiento y la evaluación cualitativa de la actividad enzimática permitieron una valoración exhaustiva de los atributos de calidad de la enzima almacenada durante un mes. El resultado obtenido fue una enzima con alto grado de pureza, específica y funcional, conservando su actividad incluso después de un mes de almacenamiento a temperaturas de 4ºC y -20ºC.spa
dc.description.degreenameTrabajo de Grado para obtener el título del Programa de Química Farmacéutica
dc.description.tableofcontents2. INTRODUCCIÓN . . . . . 5 -- 3. METODOLOGIA . . . . . 11 -- 3.1 Producción de la enzima . . . . . 11 -- 3.1.1 Preparación de material y medios de cultivo . . . . 11 -- 3.1.2 Pre - inoculo . . . . . 12 -- 3.1.3 Expresión de la enzima MMLV RT recombinante . . . . 12 -- 3.1.4 Purificación de la enzima MMLV RT recombinante . . . 12 -- 3.1.5 Regeneración columna HisTrap TM FF 1 mL . . . . 13 -- 3.2 Determinación de formulación . . . . . 14 -- 3.3 Evaluación de la estabilidad de la enzima . . . . 14 -- 3.4 Atributos de calidad de la enzima . . . . 14 -- 3.4.1 Actividad biológica . . . . . 15 -- 3.4.2 Identidad de la proteína . . . . . 16 -- 3.4.3 Cuantificación de la proteína . . . . . 16 -- 4. RESULTADOS Y DISCUSIÓN . . . . . 17 -- 5. CONCLUSIONES . . . . . 30 -- 6. AGRADECIMIENTOS . . . . . 30 -- 7. REFERENCIAS: . . . . . 31spa
dc.format.extent33 páginas
dc.format.mediumDigital
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.OLIBhttps://biblioteca2.icesi.edu.co/cgi-olib/?oid=365133
dc.identifier.instnameinstname:Universidad Icesi
dc.identifier.reponamereponame:Biblioteca Digital
dc.identifier.repourlrepourl:https://repository.icesi.edu.co/
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10906/130373
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Icesi
dc.publisher.facultyBarberi de Ingeniería, Diseño y Ciencias Aplicadas
dc.publisher.placeSantiago de cali
dc.publisher.programQuímica Farmacéutica
dc.relation.referencesWHO Coronavirus (COVID - 19) Dashboard | WHO Coronavirus (COVID - 19) Dashboard With Vaccination Data. https://covid19.who.int/.spa
dc.relation.referencesDu, J. et al. Optimal diagnostic test allocation strategy during the COVID - 19 pandemic and beyond. Stat Med 41 , 310 – 327 (2022).spa
dc.relation.referencesSemanal, B. E. 20 - 26 dic 2020. Boletín Epidemiológico Semana 52 .spa
dc.relation.referencesJ. Farfán, B. M. BIOLOGÍA MOLECULAR APLICADA AL DIAGNÓSTICO CLÍNICO. Revista Médica Clínica Las Condes 26 , 788 – 793 (2015).spa
dc.relation.referencesReacción en cadena de la polimerasa (PCR). https:/ /www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/docs/techpcr/.spa
dc.relation.referencesCebador. https:/ /www.genome.gov/genetics - glossary/Primer.spa
dc.relation.references¿Cuál es el papel del MgCl2 en las reacciones de amplificación por PCR? https:/ /www.excedr.com/resources/what - is - the - role - of - mgcl2 - in - pcr.spa
dc.relation.referencesVan Pelt - Verkuil, E., Van Belkum, A. & Hays, J. P. Principles and technical aspects of PCR amplification . Principles and Technical Aspects of PCR Amplification (Springer Netherlands, 2008). doi:10.1007/978 - 1 - 4020 - 6241 - 4.spa
dc.relation.referencesPCR: principio, pasos, tipos, componentes y aplicaciones de la PCR. https://byjus.com/biology/pcr/.spa
dc.relation.referencesMaga, G. Reverse Transcriptase. Brenner’s Encyclopedia of Genetics: Second Edition 222 – 223 (2013) doi:10.1016/B978 - 0 - 12 - 374984 - 0.01326 - 7.spa
dc.relation.referencesCoffin, J. M. & Fan, H. The Discovery of Reverse Transcriptase. Annu Rev Virol 3 , 29 – 51 (2016).spa
dc.relation.referencesBaneyx, F. & Mujacic, M. Recombinant protein folding and misfolding in Escherichia coli. Nature Biotechnology vol. 22 1399 – 1407 Preprint at https://doi.org/10.1038/nbt1029 (2004).spa
dc.relation.referencesRosano, G. L. & Ceccarelli, E. A. Recombinant protein expression in Escherichia coli: Advances and challenges. Frontiers in Microbiology vol. 5 Preprint at https://doi.org/10.3389/fmicb.2014.00172 (2014).spa
dc.relation.referencesPark, J. H., Park, H. H., Choi, S. S. & Park, T. H. Stabilization of enzymes by the recombinant 30Kc19 protein. Process Biochemistry 47 , 164 – 169 (2012).spa
dc.relation.referencesA Crommelin Robert D Sindelar Bernd Meibohm Editors Fundamentals, D. J. Pharmaceutical Biotechnology .spa
dc.relation.referencesBes, M. T., Gomez - Moreno, C., Guisan, J. M. & Fernandez - Lafuente, R. Selective oxidation: stabilisation by multipoint attachment of ferredoxin NADP+ reductase, an interesting cofactor recycling enzyme. J Mol Catal A Chem 98 , 161 – 169 (1995).spa
dc.relation.referencesUmaña, P., Kellis, J. T. & Arnold, F. H. Recombinant Protein Stabilization through Engineered Metal - Chelating Sites. in 102 – 108 (1993). doi:10.1021/bk - 1993 - 0516.ch007.spa
dc.relation.referencesBenzaghou, I., Bougie, I. & Bisaillon, M. Effect of metal ion binding on the structural stability of the hepatitis C virus RNA polymerase. J Biol Chem 279 , 49755 – 49761 (2004).spa
dc.relation.referencesInformation on Rapid Molecular Assays, RT - PCR, and other Molecular Assays for Diagnosis of Influenza Virus Infection | CDC. https:// www.cdc.gov/flu/professionals/diagnosis/molecular - assays.htm.spa
dc.relation.referencesAnnex 10 . http://www.who.int/medicines/areas/quality_safety/quality_assurance/.spa
dc.relation.referencesResolución No. 3157 de 2018.spa
dc.relation.referencesQuick Start TM Bradford Protein Assay Instruction Manual.spa
dc.relation.referencesÁlvarez Díaz, D. A. et al. An updated RT - qPCR assay for the simultaneous detection and quantification of chikungunya, dengue and zika viruses. Infection, Genetics and Evolution 93 , 104967 (2021).spa
dc.relation.referencesDe Ciencias, F. & Filosofía, Y. UNIVERSIDAD PERUANA CAYETANO HEREDIA ‘ALBERTO CAZORLA TALLERI’. (2022).spa
dc.relation.referencesKong, Y. Y., Thay, C. H., Tin, T. C. & Devi, S. Rapid detection, serotyping and quantitation of dengue viruses by TaqMan real - time one - step RT - PCR. J Virol Methods 138 , 123 – 130 (2006).spa
dc.relation.referencesTranscriptasa inversa M - MLV. https://worldwide.promega.com/products/pcr/rt - pcr/m - mlv - reverse - transcriptase/?catNum=M170spa
dc.rightsEL AUTOR, expresa que la obra objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, la obra es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. PARÁGRAFO: en caso de queja o acción por parte de un tercero referente a los derechos de autor sobre el artículo, folleto o libro en cuestión, EL AUTOR, asumirá la responsabilidad total, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos, la Universidad Icesi actúa como un tercero de buena fe. Esta autorización, permite a la Universidad Icesi, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos Todo persona que consulte ya sea la biblioteca o en medio electróico podrá copiar apartes del texto citando siempre la fuentes, es decir el título del trabajo y el autospa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.proposalRetrotranscriptasaspa
dc.subject.proposalPruebas molecularesspa
dc.subject.proposalEnzimaspa
dc.subject.proposalDiagnosticospa
dc.subject.proposalRT - PCRspa
dc.subject.proposalEnzima MMLV - RTspa
dc.subject.proposalReverse transcriptaseeng
dc.subject.proposalMolecular testseng
dc.subject.proposalEnzymeeng
dc.subject.proposalDiagnosiseng
dc.subject.proposalRT - PCReng
dc.subject.proposalMMLV - RT Enzymeeng
dc.subject.proposalTrabajos de grado de Química Farmacéuticaspa
dc.titleProducción, estabilización y evaluación de la enzima retrotranscriptasa recombinante obtenida a partir de Escherichia coli BL21(DE3)spa
dc.typebachelor thesis
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.localTrabajo de grado
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

Archivos

Bloque original

Mostrando 1 - 1 de 1
Cargando...
Miniatura
Nombre:
TG04054.pdf
Tamaño:
1.04 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format

Bloque de licencias

Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
1.71 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción: